Look at
http://www.matroska.org/technical/whatis/index.html what mkv is and wich features there are available.
Menus/chapters are available.
If you look on a makemkv generated mkv-file with Mediainfo (free download available on matroska.org), you'll see chapters there. Maybe your media player does not support this. You'll find there also some mediaplayers - f.e. "Media Player Classic", which support chapters.
F.e. DVD "Einer flog ?ber das Kuckucksnest"
Vollst?ndiger Name : C:\Video\Einer flog ?ber das Kuckucksnest\title00.mkv
Format : Matroska
Dateigr??e : 3,61 GiB
Dauer : 2h 8min
Gesamte Bitrate : 4 024 Kbps
Kodierungs-Datum : UTC 2010-09-19 09:42:41
Kodierendes Programm : MakeMKV v1.6.0 win(x86-release)
verwendete Encoder-Bibliothek : libmakemkv v1.6.0 (0.7.7/0.8.1) win(x86-release)
Video
ID : 1
Format : MPEG Video
Format-Version : Version 2
Format-Profil : Main@Main
Format-Einstellungen f?r BVOP : Nein
Format-Einstellungen f?r Matrix : ?blich
Codec-ID : V_MPEG2
Codec-ID/Info : MPEG 1 or 2 Video
Dauer : 2h 8min
Bitraten-Modus : variabel
Bitrate : 3 751 Kbps
nominale Bitrate : 7 500 Kbps
Breite : 720 Pixel
H?he : 576 Pixel
Bildseitenverh?ltnis : 16:9
Bildwiederholungsrate : 25,000 FPS
Standard : PAL
ColorSpace : YUV
ChromaSubsampling : 4:2:0
BitDepth/String : 8 bits
Scantyp : Interlaced
Scanreihenfolge : oberes Feld zuerst
Bits/(Pixel*Frame) : 0.362
Stream-Gr??e : 3,37 GiB (93%)
Sprache : Englisch
Audio
ID : 2
Format : AC-3
Format/Info : Audio Coding 3
Format_Settings_ModeExtension : CM (complete main)
Codec-ID : A_AC3
Dauer : 2h 8min
Bitraten-Modus : konstant
Bitrate : 192 Kbps
Kan?le : 1 Kanal
Kanal-Positionen : Front: C
Samplingrate : 48,0 KHz
BitDepth/String : 16 bits
Video Verz?gerung : -80ms
Stream-Gr??e : 176 MiB (5%)
Titel : 1/0
Sprache : Deutsch
Men?
00:00:00.000 : en:Chapter 01
00:04:12.920 : en:Chapter 02
00:08:22.600 : en:Chapter 03
00:13:34.120 : en:Chapter 04
00:20:29.720 : en:Chapter 05
00:24:15.120 : en:Chapter 06
00:26:31.200 : en:Chapter 07
00:30:20.680 : en:Chapter 08
00:33:02.320 : en:Chapter 09
00:37:53.240 : en:Chapter 10
00:45:37.120 : en:Chapter 11
00:47:03.880 : en:Chapter 12
00:49:33.800 : en:Chapter 13
00:52:58.040 : en:Chapter 14
00:59:47.480 : en:Chapter 15
01:03:01.120 : en:Chapter 16
01:04:26.240 : en:Chapter 17
01:06:52.520 : en:Chapter 18
01:08:06.920 : en:Chapter 19
01:16:19.760 : en:Chapter 20
01:23:31.240 : en:Chapter 21
01:26:08.560 : en:Chapter 22
01:33:09.640 : en:Chapter 23
01:34:04.400 : en:Chapter 24
01:37:29.480 : en:Chapter 25
01:40:51.880 : en:Chapter 26
01:46:21.800 : en:Chapter 27
01:48:52.000 : en:Chapter 28
01:54:24.080 : en:Chapter 29
01:57:25.240 : en:Chapter 30
01:59:21.920 : en:Chapter 31
02:04:01.600 : en:Chapter 32
02:06:18.080 : en:Chapter 33
Martin